Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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