Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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