Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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