Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PRDM2Q13029 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PRDM2Q13029 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PRDM2Q13029 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PRDM2Q13029 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PRDM2Q13029 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PRDM2Q13029 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PRDM2Q13029 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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