Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SH3BP1Q9Y3L3 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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