Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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