Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMG9Q9H0W8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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