Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms