Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTC9Q92623 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms