Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GABRA6Q16445 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms