Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms