Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NEDD8Q15843 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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