Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK3Q15120 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK3Q15120 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK3Q15120 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDK3Q15120 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PDK3Q15120 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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