Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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