Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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