Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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COL9A2Q14055 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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COL9A2Q14055 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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