Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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