Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms