Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCINQ13939 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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