Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms