Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms