Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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