Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CUL1Q13616 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms