Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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NAE1Q13564 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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NAE1Q13564 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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NAE1Q13564 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NAE1Q13564 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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