Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms