Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SRSF6Q13247 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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