Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CBX3Q13185 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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