Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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