Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN12Q05209 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms