Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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