Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRZ1P23471 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRZ1P23471 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRZ1P23471 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRZ1P23471 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms