Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA2O43364 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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