Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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