Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CRXO43186 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CRXO43186 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CRXO43186 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CRXO43186 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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