Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXD1Q9GZZ0 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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