Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RBM42Q9BTD8 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 381.6 ms