Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ZNF548Q8NEK5 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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