Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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