Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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