Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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