Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
FXNQ16595 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
FXNQ16595 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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FXNQ16595 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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FXNQ16595 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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FXNQ16595 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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FXNQ16595 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FXNQ16595 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FXNQ16595 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FXNQ16595 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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