Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms