Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ALX1Q15699 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms