Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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