Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNHIT3Q15649 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNHIT3Q15649 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms