Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB3GAP1Q15042 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB3GAP1Q15042 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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