Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHPRHQ149N8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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