Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BFSP2Q13515 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms