Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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