Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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